본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 이화여자대학교 생명과학과 이상혁 교수님의 전사체 데이터 분석를 정리한 내용입니다. Intro RNA-seq과 microarray에 대한 전반적인 내용을 알아봅니다. 전사체 연구란? Omics: 어떤 대상을 모두 모아서 연구하는 학문 Transcriptome 연구: 다양한 상황...
(EDWITH-KOBIC) 암 유전체 분석
Lecture Info Certificate
Definition of Data
본 post는 K-MOOC 고려사이버대학교(매치업) 이건길 교수님의 SQL 정형 데이터 분석 강의를 정리한 내용입니다. Intro SQL의 개념을 이해하고 설명할 수 있습니다. 데이터베이스를 정의하여 활용할 수 있습니다. 테이블을 정의하여 활용할 수 있습니다. SQL 개요 SQL 정의 SQL(Structured ...
Relational Model
본 post는 K-MOOC 고려사이버대학교(매치업) 이건길 교수님의 SQL 정형 데이터 분석 강의를 정리한 내용입니다. Intro 데이터베이스의 개념과 관계형 모델의 개념에 대해 알아봅니다. 그리고 관계형 모델을 다루는 SQL 언어에 대해 설명할 수 있습니다. 데이터베이스 개요 데이터베이스 정의 데이터베이스에 대한 ...
Variants Analysis VI - Cancer Immunotherapy
본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS를 이용하여 cancer immune analysis에 대해 알아봅니다. Cancer immune 및 면역항암의 기초, TMB(tumor mutation burden), HLA 및 HLA ...
Variants Analysis V - Cancer Analysis
본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS를 이용하여 cancer genome analysis에 대한 내용을 알아봅니다. Cancer is a Genetic Disease Cancer is a genetic disease...
Variants Analysis IV
본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS 최적 분석 파이프라인에 대해 알아봅니다. Artigacts of variant calling Artifacts of variant calling https://www.edwith...
(EDWITH-KOBIC) 후성 유전체 데이터 분석
Lecture Info Certificate
Variants Analysis III
본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS를 이용한 structural variation 탐지 방법을 알아봅니다. Structural Variations List of Structural Variations https:/...
Clustering of Single Cell & Cell Type Assignment I
본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 아주대학교 의과대학 김규태 교수님의 단일세포 클러스터링 및 Cell Type Assign (이론)을 정리한 내용입니다. Intro Clustering analysis의 의미와 종류, 방법을 이해합니다. Cell type assignment 과정을 이해합니다. Clustering Analy...