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(EDWITH-KOBIC) 암 유전체 분석

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Definition of Data

본 post는 K-MOOC 고려사이버대학교(매치업) 이건길 교수님의 SQL 정형 데이터 분석 강의를 정리한 내용입니다. Intro SQL의 개념을 이해하고 설명할 수 있습니다. 데이터베이스를 정의하여 활용할 수 있습니다. 테이블을 정의하여 활용할 수 있습니다. SQL 개요 SQL 정의 SQL(Structured ...

Relational Model

본 post는 K-MOOC 고려사이버대학교(매치업) 이건길 교수님의 SQL 정형 데이터 분석 강의를 정리한 내용입니다. Intro 데이터베이스의 개념과 관계형 모델의 개념에 대해 알아봅니다. 그리고 관계형 모델을 다루는 SQL 언어에 대해 설명할 수 있습니다. 데이터베이스 개요 데이터베이스 정의 데이터베이스에 대한 ...

Variants Analysis VI - Cancer Immunotherapy

본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS를 이용하여 cancer immune analysis에 대해 알아봅니다. Cancer immune 및 면역항암의 기초, TMB(tumor mutation burden), HLA 및 HLA ...

Variants Analysis V - Cancer Analysis

본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS를 이용하여 cancer genome analysis에 대한 내용을 알아봅니다. Cancer is a Genetic Disease Cancer is a genetic disease...

Variants Analysis IV

본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS 최적 분석 파이프라인에 대해 알아봅니다. Artigacts of variant calling Artifacts of variant calling https://www.edwith...

(EDWITH-KOBIC) 후성 유전체 데이터 분석

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Variants Analysis III

본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 연세대학교 의과대학 김상우 교수님의 NGS 데이터 분석 기초 강의를 정리한 내용입니다. Intro NGS를 이용한 structural variation 탐지 방법을 알아봅니다. Structural Variations List of Structural Variations https:/...

Clustering of Single Cell & Cell Type Assignment I

본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 아주대학교 의과대학 김규태 교수님의 단일세포 클러스터링 및 Cell Type Assign (이론)을 정리한 내용입니다. Intro Clustering analysis의 의미와 종류, 방법을 이해합니다. Cell type assignment 과정을 이해합니다. Clustering Analy...

Preprocessing of Single Cell Analysis II

본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 아주대학교 의과대학 김규태 교수님의 단일세포 전사체 데이터 전분석 (실습)을 정리한 내용입니다. Intro Single cell data의 mapping, normalization, batch 제거 과정을 이해합니다. Single Cell Data Mapping Basic Data ...