본 post는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 주관 아주대학교 의과대학 김규태 교수님의 단일세포 클러스터링 및 Cell Type Assign (이론)을 정리한 내용입니다.
Intro
Clustering analysis의 의미와 종류, 방법을 이해합니다. Cell type assignment 과정을 이해합니다.
Clustering Analysis
Clustering Analysis
https://www.edwith.org/single-cell/lecture/1417886
Clustering이란 그림과 같이 특정 기준에 따라 유사한 것끼리 묶는 과정입니다.
Evaluation of Clustering
https://www.edwith.org/single-cell/lecture/1417886
Clustering 평가 방법은, 같은 cluster에 속하는 요소끼리 거리는 가까울수록(intra-scluster distance), 서로 다른 cluster끼리 거리는 멀수록(inter-cluster distance) good clustering으로 평가할 수 있습니다.
Clustering 방법과 종류
5강 15:13
Take Home Message
Single cell analysis 전반적인 분석 과정에 대해 알아볼 수 있었습니다.