Portfolio

Jonghyuk Kim

2014년부터 마크로젠에서 NGS 데이터를 다뤄 왔습니다. 임상 유전체 인증과 분석 파이프라인 운영을 거쳐, 지금은 전사체·단일세포 데이터 분석 팀을 이끌고 있습니다.

Career

Macrogen · 12년 4개월
  1. Principal Researcher

    Macrogen현재
    2024.05 – 현재 · 2년 3개월 · 서울, 대한민국
    Transcriptome Data Analysis Team · Team Leader
    • ·팀 운영
    • ·전사체(Transcriptome) NGS 데이터 분석
    • ·단일세포 분석 — 10x Chromium, Spatial
  2. Senior Researcher

    Macrogen
    2021.01 – 2024.05 · 3년 4개월 · 서울, 대한민국
    Clinical Data Analysis Team · Team Leader
    • ·팀 운영
    • ·NGS 데이터 분석
    • ·임상 인증 대응
  3. Assistant Researcher

    Macrogen
    2017.03 – 2021.01 · 3년 10개월 · 서울, 대한민국
    Clinical Cancer Genomics Team
    • ·NGS 데이터 전처리 — Illumina, PacBio
    • ·NGS 분석 파이프라인 구축·운영·유지보수
    • ·WGS / WES / 암 타깃 패널 데이터 분석
    • ·CAP · KIGTE · 식약처 NGS 임상검사실 인증 취득 참여
    • ·인증 정기 숙련도 평가 수행
    • ·BRCA 분석 소프트웨어 개발 및 CE-IVDR(2017/746) 획득
  4. Researcher

    Macrogen
    2014.04 – 2017.03 · 2년 11개월 · 서울, 대한민국
    General NGS Data Analysis Team
    • ·NGS 데이터 전처리 — Illumina, PacBio
    • ·비인간(non-Human) 재분석 데이터 분석

Education

한동대학교

Handong Global University
Bachelor of Science (BS) · Biomedical Sciences, General
2006 – 2013
SOUL

Skills

Genomics & Bioinformatics
BioinformaticsGenomicsTranscriptomicsSingle-cell AnalysisMulti-omicsSystems BiologyPrecision MedicineOncologyBiomarker Discovery
Drug Discovery & Protein
Drug DiscoveryProtein StructureAlphaFoldADMETMedicinal Chemistry
Machine Learning & Data
Machine LearningDeep LearningArtificial IntelligenceBig DataData AnalysisStatistics
Tools & Foundations
PythonRSQL & DatabasesAlgorithmsMedical Informatics

Projects

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Coursework

8개 기관 · 92개 과정
AI 신약개발시 알아야 할 항암제 개요
LAIDD

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2024.01.07
의약품 허가 및 상업용 생산을 위한 기술이전
LAIDD

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2024.01.06
인공지능 빅데이터 활용 신약개발 연구동향 및 연구사례
LAIDD

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2024.01.06
단백질 서열 정렬 알고리즘과 실습
LAIDD

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2023.12.31
단백질 언어 모델을 활용한 컨텍트 예측
LAIDD

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2023.12.31
알파폴드를 이용한 단백질 구조 예측 및 평가
LAIDD

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2023.12.31
신약개발을 위한 단백질 구조 예측 및 상호작용 예측
LAIDD

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2023.12.30
네트워크 기반 멀티오믹스 데이터 통합 실습
LAIDD

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2023.12.29
인공지능을 활용한 멀티오믹스 기반 바이오마커 발굴
LAIDD

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2023.12.29
생물학 and 생물정보학 역량강화 교육과정
LAIDD

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2023.12.28
시스템 생물학을 활용한 신호전달 경로 모델링
LAIDD

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2023.12.28
기계학습 및 네트워크 구조를 활용한 정밀의학
LAIDD

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2023.12.25
빅데이터를 활용한 비임상시험 동물모델 개발
LAIDD

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2023.12.25
타겟발굴을 위한 유전체 변이분석기술
LAIDD

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2023.12.23
약물-전사체 기반 약물 기전해석 및 신약재창출
LAIDD

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2023.10.16
Data Analysis of Longread Sequencing
edwith· KOBIC

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2023.07.12
Basic of ML and DL for Cancer Genomics
edwith· KOBIC

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2023.06.26
Artificial Intelligence Algorithms Models and Limitations
Coursera

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2023.06.18
데이터 분석과 비즈니스를 위한 기초 통계학_상
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2023.05.04
데이터 분석과 비즈니스를 위한 기초 통계학_하
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2023.05.04
Introduction to Genomic Technologies
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2022.12.12
빅데이터 분야 빅데이터 가공 및 분석 과정
직무능력 인증서

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2022.12.07
빅데이터 분야 수학적 사고 과정
직무능력 인증서

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2022.12.07
Python으로 시작하는 Kaggle 포트폴리오 만들기
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2022.11.27
예제 데이터를 활용한 전사체 데이터 분석
edwith· KOBIC

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2022.09.26
R을 활용한 데이터 분석(중급)
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2022.08.30
NGS 데이터 변이 분석 기초편
edwith· KOBIC

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2022.07.05
Python3 Programming
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2022.05.28
Data Collection and Processing with Python
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2022.05.28
Introduction to Data Science in Python
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2022.05.28
Python Classes and Inheritance
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2022.05.28
Python Functions, Files, and Dictionaries
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2022.05.28
Python Project - pillow, tesseract, and opencv
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2022.05.28
오픈소스를 활용한 DevOps 환경 이해
K-MOOC

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2022.05.28
파이썬 기반 빅데이터 처리 및 분석 기술
K-MOOC

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2022.05.28