발생과 T2D를 아우르는 400만 세포 규모 인간 췌장 멀티오믹스 아틀라스

췌장은 대사 질환의 핵심 장기임에도 세포 다양성과 형태 변화에 따른 가소성에 대한 분자 수준의 이해는 여전히 제한적이었다. 연구진은 태아 발생기부터 성인 정상 및 2형 당뇨병 기증자 57명에게서 얻은 400만 개 이상의 세포와 핵을 다중 오믹스로 통합 분석했다. 이를 통해 단일세포 전사체, 염색질 접근성, 공간 조직화 및 단백질 발현을 고해상도로 통합 재구성했다.

무엇을 했나

• 태아 발생, 성인 정상, 2형 당뇨병 기증자 57명으로부터 400만 개 이상의 세포 및 핵을 확보해 sc/snRNA-seq, snATAC-seq, VASA-seq, Xenium, CODEX 데이터를 구축했다.
• 통합 멀티오믹스 분석을 통해 태아기 특성을 유지한 성인 내 췌관중심 유사 세포(pCACs)를 발굴하고 내·외분비 세포의 분화 궤적을 정립했다.
• 2형 당뇨병 상태에서 베타 세포 서브타입의 비율 변화와 조절 네트워크 변형을 확인하고 HNF1A 중심의 후성유전학적 상태를 정의했다.
• 정상 췌도 조직에 포도당 자극을 주어 세포 유형에 따른 대사 적응 및 스트레스 응답 반응을 추적했다.

왜 눈여겨볼 만한가

단일세포 전사체 중심이던 기존 췌장 데이터베이스를 snATAC-seq, VASA-seq, Xenium, CODEX까지 확장해 후성유전체와 공간·단백질 수준의 상호작용을 한 번에 검증할 수 있는 기준점을 제공한다. 발생 단계부터 질환 및 기능 자극 상태까지 아우르고 있어 췌장 세포의 재분화나 가소성을 연구하는 실험실에서 대조군 데이터셋으로 유용하게 쓰일 것으로 보인다. 다만 여러 기증자 및 옴니버스 플랫폼 간 데이터를 통합하는 과정에서 생기는 기술적 배치 효과와 전사체-공간 단백질 데이터 간의 해상도 불일치는 개별 타깃 검증 시 유의할 필요가 있다.

원문

• Cell metabolism · DOI 10.1016/j.cmet.2026.07.023