트리오 WES·WGS 기반 heterotaxy 환아 및 태아의 유전자 변이 분석

복합 선천성 심장 기형을 동반하는 내장 역위증(Heterotaxy)은 낮은 생존율에도 불구하고 NGS 기반 분자 진단율이 20~30% 수준에 머물러 있다. 연구진은 프랑스와 베트남의 환아 및 태아 7례를 대상으로 트리오 WES·WGS와 태아병리 검사를 통합 수행하고 문헌 108례를 체계적으로 분석했다. 이를 통해 미보고 변이를 포함한 주요 원인 유전자 변이를 발굴하고 표현형과의 연관성을 정립했다.

무엇을 했나

• 프랑스 및 베트남의 heterotaxy 환아 및 태아 7례를 대상으로 트리오 기반 WES 및 WGS를 수행했다.
• 태아병리학적 데이터와 유전체 데이터를 통합 분석하고, 기존 출판된 108례에 대한 체계적 문헌고찰을 병행했다.
• DNAH9, PKD1L1, MMP21, GDF1 유전자에서 미보고 변이 2종을 포함한 총 7개의 관련 변이를 발굴했다.
• MMP21 및 GDF1 변이가 중증 원심원추부(conotruncal) 심장 기형과 강하게 연관되어 있음을 입증했다.

왜 눈여겨볼 만한가

진단율이 낮은 산전·신생아 희귀 질환에서 트리오 기반 WGS·WES와 상세 병리 검사를 결합하는 방식의 유용성을 보여준다. 특히 MMP21과 GDF1 변이는 산전 진단 시 중증 심장 기형 가능성을 예측하는 유전 변이 후보로 검토해 볼 만하다. 다만 본 연구의 자체 코호트가 7례로 소수이고 문헌 의존도가 높아, 진단 패널 구성에 직접 적용하기에는 추가적인 대규모 검증이 필요할 것으로 보인다.

원문

• Clinical genetics · DOI 10.1111/cge.70227