나노포어 롱읽기 시퀀싱으로 규명한 혈우병 구조변이

혈우병 원인 유전자인 F8과 F9의 구조변이는 기존 단일읽기 시퀀싱이나 MLPA로 정확한 양상을 파악하기 어려운 경우가 많았다. 이 연구는 롱읽기 시퀀싱을 도입해 기존 검사에서 놓쳤던 브레이크포인트와 복잡한 유전체 구조를 정밀하게 해독하고자 했다.

무엇을 했나

• 비정형 구조변이를 가진 혈우병 A 20가계와 혈우병 B 5가계를 대상으로 지놈 워킹, 단일읽기 시퀀싱, 나노포어 전장 유전체 롱읽기 시퀀싱(WGS-LRS)을 통합 적용했다.
• 혈우병 A에서는 부분 결실, 탠덤 중복, 복잡한 재배열을 확인했으며 혈우병 B에서는 대규모 결실과 Alu 삽입을 규명했다.
• 일부 사례에서 기존 MLPA 분석의 불완전하거나 오인된 결과를 WGS-LRS가 바로잡았다.
• 브레이크포인트 접합부 분석을 통해 반복 서열과 미세동일성이 SV 형성의 주요 기전임을 확인했다.

왜 눈여겨볼 만한가

표준 검사법으로 진단이 모호했던 복잡한 SV 영역에서 나노포어 WGS-LRS가 정확한 브레이크포인트를 찾는 데 유용함을 보여준다. 다만 임상 현장에서 routine으로 도입하기에는 비용과 분석 파이프라인 구축 측면의 제약이 있을 수 있으므로, 기존 검사로 원인이 밝히기 어려운 난해한 케이스에 한해 우선적으로 고려해 볼 만하다.

원문

• Blood advances · DOI 10.1182/bloodadvances.2026021414