옥스포드 나노포어 저커버리지 WGS 기반 급성 골수성 백혈병 핵형 분석

기존의 중기세포 핵형 분석은 염색체 이상을 진단하는 표준 방법이지만 소요 시간이 길어 임상 치료 결정을 지연시키는 한계가 있었다. 본 연구는 옥스포드 나노포어 롱읽기 시퀀싱을 활용한 저커버리지 전유전체 시퀀싱(lcWGS)을 통해 신속하고 확장 가능한 세포유전학적 프로파일링 대안을 제시한다.

무엇을 했나

• 고위험군 핵형이 알려진 후향적 환자 50명과 전향적으로 등록된 신규 AML 환자 50명 등 총 100개의 진단용 AML 샘플을 분석했다.
• 옥스포드 나노포어 기술을 이용한 저커버리지 전유전체 시퀀싱(lcWGS)으로 염색체 이상을 탐지했다.
• 민감도, 특이도, 전반적인 정확도에서 각각 93%의 성능을 확인했고 복잡핵형 탐지의 AUC는 0.971을 기록했다.
• 두 독립된 실험실 간의 replicate 시퀀싱을 통해 재현성(R = 0.99)을 검증했다.

왜 눈여겨볼 만한가

샘플 접수부터 바이오인포매틱스 해석까지 중앙값 약 34시간 만에 완료되어 72시간 내에 임상적으로 유의미한 결과를 제공할 수 있다는 점이 가장 큰 장점이다. 다만 lcWGS로 추정된 클론 크기는 기존 세포유전학적 평가와 중등도의 상관관계(R = 0.54)를 보여 정량적 분석 측면에서는 해석에 유의할 필요가 있다. 기존 핵형 분석의 긴 소요 시간을 보완하고 신속한 위험도 층화와 치료 시작이 필요한 급성 골수성 백혈병 환자에게 유용한 대안으로 검토해 볼 만하다.

원문

• Blood advances · DOI 10.1182/bloodadvances.2026019960