직장암 선행화항요법 반응을 규명하는 종단 프로테오믹스와 다중오믹스 통합 분석

국소 진행성 직장암에서 선행화학요법의 반응 예측 인자는 여전히 명확하지 않다. 이 연구는 대규모 환자의 치료 전후 종단 프로테오믹스와 다중오믹스 통합 분석을 통해 치료 반응을 결정하는 분자적 요인을 추적한다.

무엇을 했나

• 156명의 직장암 환자(매칭된 치료 전후 검체 31명 포함)를 대상으로 4D-DIA 프로테오믹스 프로파일링을 수행하고 벌크 RNA-seq 및 단일세포 전사체와 통합했다.
• 치료 전 반응군은 면역 경로가 우세한 반면, 비반응군은 증식 및 대사 프로그램이 활성화되어 있음을 확인했다.
• 치료 전 발현되는 RAC2가 반응 예측 마커(훈련 AUC 0.867, 테스트 AUC 0.857)로서 면역 활성화 및 옥살리플라틴 민감성과 연관됨을 외부 코호트로 검증했다.
• 단일세포 분석을 통해 종양의 RAC2가 CD8+ T세포와 신호를 주고받으며, 치료 중 반응군에서만 CD8+ T세포 침윤이 유지되는 것을 확인했다.

왜 눈여겨볼 만한가

치료 전후의 단백체 변화를 대규모로 추적하고 이를 단일세포 레벨의 세포 간 신호 전달과 연결했다는 점에서 유용하다. 특히 RAC2를 옥살리플라틴 반응 및 면역 활성화의 예측 바이오마커로 제시했으나, 기능 밸리데이션에서 락다운 시 종양 성장 양상이 복잡하게 나타난 점은 임상 적용 전 추가 검토가 필요해 보인다. 프로테오믹스와 단일세포 전사체를 동시 구축해야 하는 부담이 있지만, 직장암 미세환경 리모델링 연구에 참고할 만하다.

원문

• Pharmacological research · DOI 10.1016/j.phrs.2026.109699